Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU3F4P49335 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POU3F4P49335 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F4P49335 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POU3F4P49335 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU3F4P49335 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POU3F4P49335 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms