Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP13P45452 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP13P45452 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP13P45452 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP13P45452 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP13P45452 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP13P45452 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP13P45452 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP13P45452 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP13P45452 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP13P45452 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP13P45452 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP13P45452 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP13P45452 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP13P45452 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP13P45452 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP13P45452 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP13P45452 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP13P45452 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP13P45452 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP13P45452 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP13P45452 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP13P45452 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP13P45452 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP13P45452 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP13P45452 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP13P45452 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP13P45452 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP13P45452 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP13P45452 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP13P45452 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP13P45452 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP13P45452 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP13P45452 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP13P45452 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP13P45452 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP13P45452 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP13P45452 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP13P45452 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP13P45452 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP13P45452 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP13P45452 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP13P45452 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP13P45452 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP13P45452 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP13P45452 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP13P45452 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP13P45452 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MMP13P45452 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP13P45452 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP13P45452 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP13P45452 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP13P45452 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP13P45452 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP13P45452 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP13P45452 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP13P45452 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP13P45452 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP13P45452 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP13P45452 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP13P45452 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP13P45452 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP13P45452 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP13P45452 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP13P45452 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP13P45452 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP13P45452 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP13P45452 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP13P45452 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP13P45452 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP13P45452 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP13P45452 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP13P45452 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP13P45452 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP13P45452 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP13P45452 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP13P45452 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP13P45452 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP13P45452 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP13P45452 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP13P45452 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP13P45452 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP13P45452 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP13P45452 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP13P45452 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP13P45452 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP13P45452 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP13P45452 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP13P45452 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP13P45452 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP13P45452 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP13P45452 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP13P45452 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP13P45452 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP13P45452 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP13P45452 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP13P45452 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP13P45452 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP13P45452 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP13P45452 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms