Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGFRP43088 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGFRP43088 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGFRP43088 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGFRP43088 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRP43088 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRP43088 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms