Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU1F1P28069 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU1F1P28069 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU1F1P28069 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU1F1P28069 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU1F1P28069 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU1F1P28069 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POU1F1P28069 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POU1F1P28069 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POU1F1P28069 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POU1F1P28069 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POU1F1P28069 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU1F1P28069 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POU1F1P28069 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POU1F1P28069 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms