Protein–RNA interactions for Protein: P16471

PRLR, Prolactin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRLRP16471 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRLRP16471 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRLRP16471 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRLRP16471 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRLRP16471 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRLRP16471 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRLRP16471 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRLRP16471 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRLRP16471 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRLRP16471 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRLRP16471 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRLRP16471 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRLRP16471 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRLRP16471 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRLRP16471 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRLRP16471 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRLRP16471 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRLRP16471 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRLRP16471 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRLRP16471 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRLRP16471 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRLRP16471 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRLRP16471 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRLRP16471 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRLRP16471 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRLRP16471 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRLRP16471 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRLRP16471 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRLRP16471 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRLRP16471 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRLRP16471 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRLRP16471 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRLRP16471 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRLRP16471 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRLRP16471 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRLRP16471 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRLRP16471 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRLRP16471 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRLRP16471 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRLRP16471 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRLRP16471 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRLRP16471 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRLRP16471 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRLRP16471 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRLRP16471 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRLRP16471 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRLRP16471 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRLRP16471 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRLRP16471 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRLRP16471 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRLRP16471 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRLRP16471 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRLRP16471 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRLRP16471 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRLRP16471 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRLRP16471 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRLRP16471 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRLRP16471 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRLRP16471 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRLRP16471 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRLRP16471 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRLRP16471 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRLRP16471 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRLRP16471 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRLRP16471 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRLRP16471 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PRLRP16471 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PRLRP16471 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRLRP16471 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRLRP16471 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRLRP16471 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRLRP16471 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRLRP16471 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRLRP16471 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRLRP16471 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRLRP16471 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRLRP16471 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRLRP16471 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRLRP16471 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRLRP16471 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRLRP16471 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRLRP16471 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRLRP16471 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRLRP16471 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRLRP16471 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRLRP16471 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRLRP16471 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRLRP16471 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRLRP16471 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRLRP16471 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRLRP16471 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRLRP16471 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRLRP16471 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRLRP16471 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRLRP16471 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRLRP16471 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRLRP16471 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRLRP16471 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRLRP16471 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRLRP16471 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms