Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
F5P12259 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
F5P12259 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
F5P12259 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
F5P12259 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F5P12259 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F5P12259 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
F5P12259 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F5P12259 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F5P12259 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
F5P12259 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
F5P12259 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
F5P12259 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F5P12259 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F5P12259 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F5P12259 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
F5P12259 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F5P12259 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
F5P12259 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
F5P12259 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F5P12259 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F5P12259 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
F5P12259 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
F5P12259 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F5P12259 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F5P12259 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
F5P12259 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F5P12259 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
F5P12259 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F5P12259 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
F5P12259 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F5P12259 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F5P12259 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F5P12259 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F5P12259 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
F5P12259 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F5P12259 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F5P12259 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
F5P12259 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
F5P12259 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
F5P12259 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F5P12259 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F5P12259 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F5P12259 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F5P12259 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F5P12259 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F5P12259 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F5P12259 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F5P12259 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
F5P12259 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
F5P12259 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F5P12259 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F5P12259 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F5P12259 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F5P12259 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F5P12259 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F5P12259 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F5P12259 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
F5P12259 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F5P12259 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F5P12259 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
F5P12259 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F5P12259 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F5P12259 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F5P12259 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F5P12259 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
F5P12259 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F5P12259 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F5P12259 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
F5P12259 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
F5P12259 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F5P12259 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F5P12259 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F5P12259 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
F5P12259 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F5P12259 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
F5P12259 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
F5P12259 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
F5P12259 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
F5P12259 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F5P12259 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F5P12259 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F5P12259 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F5P12259 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F5P12259 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
F5P12259 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
F5P12259 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
F5P12259 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
F5P12259 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
F5P12259 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
F5P12259 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
F5P12259 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
F5P12259 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
F5P12259 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
F5P12259 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F5P12259 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
F5P12259 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F5P12259 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F5P12259 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
F5P12259 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms