Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ESRRAP11474 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ESRRAP11474 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESRRAP11474 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESRRAP11474 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESRRAP11474 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ESRRAP11474 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ESRRAP11474 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ESRRAP11474 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ESRRAP11474 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ESRRAP11474 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ESRRAP11474 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms