Protein–RNA interactions for Protein: P10163

PRB4, Basic salivary proline-rich protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB4P10163 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB4P10163 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB4P10163 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB4P10163 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB4P10163 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB4P10163 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB4P10163 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB4P10163 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB4P10163 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB4P10163 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRB4P10163 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRB4P10163 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRB4P10163 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB4P10163 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB4P10163 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB4P10163 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB4P10163 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB4P10163 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRB4P10163 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRB4P10163 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRB4P10163 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PRB4P10163 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRB4P10163 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRB4P10163 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRB4P10163 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRB4P10163 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB4P10163 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB4P10163 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB4P10163 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB4P10163 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB4P10163 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB4P10163 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB4P10163 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB4P10163 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB4P10163 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB4P10163 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB4P10163 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB4P10163 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB4P10163 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB4P10163 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB4P10163 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB4P10163 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB4P10163 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB4P10163 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB4P10163 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB4P10163 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB4P10163 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB4P10163 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB4P10163 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB4P10163 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB4P10163 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB4P10163 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB4P10163 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB4P10163 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB4P10163 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB4P10163 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB4P10163 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB4P10163 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRB4P10163 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRB4P10163 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRB4P10163 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRB4P10163 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRB4P10163 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRB4P10163 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRB4P10163 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRB4P10163 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB4P10163 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB4P10163 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB4P10163 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB4P10163 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB4P10163 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB4P10163 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRB4P10163 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRB4P10163 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB4P10163 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB4P10163 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB4P10163 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB4P10163 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB4P10163 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB4P10163 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRB4P10163 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB4P10163 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRB4P10163 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB4P10163 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB4P10163 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRB4P10163 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRB4P10163 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRB4P10163 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRB4P10163 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRB4P10163 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB4P10163 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB4P10163 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB4P10163 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRB4P10163 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRB4P10163 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRB4P10163 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRB4P10163 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRB4P10163 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRB4P10163 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRB4P10163 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms