Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PNMA6AP0CW24 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PNMA6AP0CW24 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA6AP0CW24 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA6AP0CW24 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA6AP0CW24 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA6AP0CW24 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA6AP0CW24 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA6AP0CW24 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA6AP0CW24 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA6AP0CW24 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA6AP0CW24 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA6AP0CW24 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA6AP0CW24 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA6AP0CW24 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA6AP0CW24 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA6AP0CW24 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNMA6AP0CW24 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNMA6AP0CW24 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNMA6AP0CW24 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA6AP0CW24 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PNMA6AP0CW24 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA6AP0CW24 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA6AP0CW24 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNMA6AP0CW24 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA6AP0CW24 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA6AP0CW24 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNMA6AP0CW24 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.1 ms