Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRATO95237 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRATO95237 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRATO95237 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRATO95237 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRATO95237 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRATO95237 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRATO95237 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRATO95237 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRATO95237 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRATO95237 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRATO95237 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRATO95237 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRATO95237 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRATO95237 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRATO95237 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRATO95237 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRATO95237 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRATO95237 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRATO95237 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRATO95237 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRATO95237 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRATO95237 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRATO95237 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRATO95237 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRATO95237 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRATO95237 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRATO95237 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRATO95237 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRATO95237 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRATO95237 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRATO95237 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRATO95237 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRATO95237 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRATO95237 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRATO95237 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRATO95237 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRATO95237 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRATO95237 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRATO95237 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRATO95237 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRATO95237 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRATO95237 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRATO95237 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRATO95237 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRATO95237 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRATO95237 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRATO95237 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRATO95237 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRATO95237 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRATO95237 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRATO95237 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRATO95237 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRATO95237 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRATO95237 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRATO95237 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRATO95237 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRATO95237 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRATO95237 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRATO95237 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRATO95237 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRATO95237 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRATO95237 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRATO95237 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRATO95237 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRATO95237 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRATO95237 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRATO95237 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRATO95237 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRATO95237 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRATO95237 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRATO95237 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRATO95237 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRATO95237 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRATO95237 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRATO95237 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRATO95237 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRATO95237 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
LRATO95237 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRATO95237 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRATO95237 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRATO95237 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRATO95237 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRATO95237 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRATO95237 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRATO95237 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRATO95237 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRATO95237 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRATO95237 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRATO95237 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRATO95237 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRATO95237 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRATO95237 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRATO95237 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRATO95237 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRATO95237 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRATO95237 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRATO95237 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRATO95237 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRATO95237 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms