Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA2O75334 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA2O75334 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA2O75334 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA2O75334 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA2O75334 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA2O75334 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPFIA2O75334 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIA2O75334 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA2O75334 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA2O75334 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA2O75334 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA2O75334 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA2O75334 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA2O75334 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA2O75334 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA2O75334 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA2O75334 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA2O75334 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA2O75334 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms