Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMDSO60547 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMDSO60547 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMDSO60547 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMDSO60547 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMDSO60547 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMDSO60547 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMDSO60547 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMDSO60547 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMDSO60547 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMDSO60547 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMDSO60547 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMDSO60547 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMDSO60547 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMDSO60547 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMDSO60547 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMDSO60547 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMDSO60547 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMDSO60547 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMDSO60547 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMDSO60547 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMDSO60547 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMDSO60547 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMDSO60547 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMDSO60547 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GMDSO60547 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMDSO60547 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMDSO60547 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMDSO60547 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMDSO60547 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMDSO60547 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMDSO60547 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMDSO60547 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMDSO60547 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMDSO60547 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMDSO60547 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMDSO60547 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMDSO60547 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMDSO60547 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMDSO60547 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMDSO60547 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMDSO60547 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMDSO60547 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMDSO60547 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMDSO60547 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMDSO60547 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMDSO60547 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMDSO60547 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMDSO60547 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMDSO60547 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMDSO60547 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMDSO60547 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMDSO60547 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMDSO60547 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMDSO60547 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMDSO60547 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMDSO60547 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMDSO60547 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMDSO60547 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMDSO60547 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMDSO60547 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMDSO60547 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMDSO60547 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMDSO60547 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMDSO60547 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMDSO60547 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMDSO60547 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMDSO60547 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMDSO60547 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMDSO60547 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMDSO60547 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMDSO60547 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMDSO60547 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMDSO60547 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMDSO60547 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMDSO60547 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMDSO60547 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMDSO60547 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMDSO60547 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMDSO60547 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMDSO60547 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMDSO60547 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMDSO60547 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMDSO60547 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMDSO60547 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMDSO60547 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMDSO60547 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMDSO60547 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMDSO60547 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMDSO60547 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMDSO60547 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMDSO60547 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMDSO60547 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMDSO60547 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMDSO60547 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GMDSO60547 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMDSO60547 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMDSO60547 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMDSO60547 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMDSO60547 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms