Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRTO14522 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRTO14522 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PTPRTO14522 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PTPRTO14522 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PTPRTO14522 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PTPRTO14522 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PTPRTO14522 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PTPRTO14522 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PTPRTO14522 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PTPRTO14522 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PTPRTO14522 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PTPRTO14522 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PTPRTO14522 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PTPRTO14522 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PTPRTO14522 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PTPRTO14522 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
PTPRTO14522 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PTPRTO14522 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PTPRTO14522 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PTPRTO14522 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PTPRTO14522 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PTPRTO14522 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PTPRTO14522 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PTPRTO14522 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PTPRTO14522 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PTPRTO14522 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PTPRTO14522 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PTPRTO14522 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PTPRTO14522 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PTPRTO14522 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PTPRTO14522 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PTPRTO14522 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PTPRTO14522 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PTPRTO14522 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
PTPRTO14522 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PTPRTO14522 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PTPRTO14522 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PTPRTO14522 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRTO14522 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRTO14522 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRTO14522 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PTPRTO14522 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRTO14522 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PTPRTO14522 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PTPRTO14522 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRTO14522 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRTO14522 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRTO14522 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PTPRTO14522 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PTPRTO14522 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
PTPRTO14522 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRTO14522 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PTPRTO14522 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
PTPRTO14522 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRTO14522 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRTO14522 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PTPRTO14522 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PTPRTO14522 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PTPRTO14522 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PTPRTO14522 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.01■■■■■ 4
PTPRTO14522 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRTO14522 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PTPRTO14522 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PTPRTO14522 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PTPRTO14522 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PTPRTO14522 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRTO14522 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRTO14522 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRTO14522 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRTO14522 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PTPRTO14522 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRTO14522 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
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