Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.92■■■■■ 5.74
PTPRTO14522 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.67■■■■■ 5.7
PTPRTO14522 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.4■■■■■ 5.66
PTPRTO14522 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
PTPRTO14522 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
PTPRTO14522 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
PTPRTO14522 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
PTPRTO14522 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.83■■■■■ 5.41
PTPRTO14522 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
PTPRTO14522 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
PTPRTO14522 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.57■■■■■ 5.37
PTPRTO14522 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.5■■■■■ 5.36
PTPRTO14522 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
PTPRTO14522 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
PTPRTO14522 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
PTPRTO14522 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.82■■■■■ 5.25
PTPRTO14522 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.21
PTPRTO14522 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
PTPRTO14522 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
PTPRTO14522 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
PTPRTO14522 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
PTPRTO14522 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
PTPRTO14522 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
PTPRTO14522 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.94■■■■■ 5.1
PTPRTO14522 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
PTPRTO14522 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
PTPRTO14522 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
PTPRTO14522 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
PTPRTO14522 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
PTPRTO14522 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
PTPRTO14522 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
PTPRTO14522 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
PTPRTO14522 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
PTPRTO14522 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
PTPRTO14522 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
PTPRTO14522 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
PTPRTO14522 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
PTPRTO14522 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
PTPRTO14522 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
PTPRTO14522 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
PTPRTO14522 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
PTPRTO14522 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
PTPRTO14522 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PTPRTO14522 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
PTPRTO14522 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
PTPRTO14522 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
PTPRTO14522 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
PTPRTO14522 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
PTPRTO14522 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
PTPRTO14522 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
PTPRTO14522 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
PTPRTO14522 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PTPRTO14522 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
PTPRTO14522 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.02■■■■■ 4.8
PTPRTO14522 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
PTPRTO14522 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
PTPRTO14522 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
PTPRTO14522 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.84■■■■■ 4.77
PTPRTO14522 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
PTPRTO14522 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PTPRTO14522 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
PTPRTO14522 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
PTPRTO14522 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
PTPRTO14522 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
PTPRTO14522 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
PTPRTO14522 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
PTPRTO14522 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
PTPRTO14522 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
PTPRTO14522 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
PTPRTO14522 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
PTPRTO14522 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
PTPRTO14522 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
PTPRTO14522 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PTPRTO14522 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
PTPRTO14522 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
PTPRTO14522 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
PTPRTO14522 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PTPRTO14522 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
PTPRTO14522 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
PTPRTO14522 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
PTPRTO14522 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
PTPRTO14522 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
PTPRTO14522 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.64
PTPRTO14522 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.64
PTPRTO14522 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PTPRTO14522 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
PTPRTO14522 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
PTPRTO14522 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PTPRTO14522 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PTPRTO14522 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
PTPRTO14522 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
PTPRTO14522 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PTPRTO14522 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
PTPRTO14522 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
PTPRTO14522 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
PTPRTO14522 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PTPRTO14522 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
PTPRTO14522 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
PTPRTO14522 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
PTPRTO14522 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
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