Protein–RNA interactions for Protein: O00168

FXYD1, Phospholemman, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD1O00168 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FXYD1O00168 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FXYD1O00168 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FXYD1O00168 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FXYD1O00168 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FXYD1O00168 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FXYD1O00168 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FXYD1O00168 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FXYD1O00168 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FXYD1O00168 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FXYD1O00168 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FXYD1O00168 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FXYD1O00168 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FXYD1O00168 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FXYD1O00168 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FXYD1O00168 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FXYD1O00168 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FXYD1O00168 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FXYD1O00168 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms