Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPIPB6E9PJ23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPIPB6E9PJ23 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB6E9PJ23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB6E9PJ23 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB6E9PJ23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB6E9PJ23 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.6 ms