Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C5orf60A6NFR6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C5orf60A6NFR6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C5orf60A6NFR6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C5orf60A6NFR6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C5orf60A6NFR6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C5orf60A6NFR6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C5orf60A6NFR6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C5orf60A6NFR6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C5orf60A6NFR6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C5orf60A6NFR6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C5orf60A6NFR6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5orf60A6NFR6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C5orf60A6NFR6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5orf60A6NFR6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf60A6NFR6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf60A6NFR6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf60A6NFR6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5orf60A6NFR6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5orf60A6NFR6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5orf60A6NFR6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C5orf60A6NFR6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms