Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBA8Q9NY65 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA8Q9NY65 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBA8Q9NY65 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBA8Q9NY65 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBA8Q9NY65 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBA8Q9NY65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA8Q9NY65 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA8Q9NY65 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBA8Q9NY65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBA8Q9NY65 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBA8Q9NY65 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA8Q9NY65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBA8Q9NY65 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBA8Q9NY65 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBA8Q9NY65 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBA8Q9NY65 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA8Q9NY65 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA8Q9NY65 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBA8Q9NY65 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA8Q9NY65 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA8Q9NY65 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBA8Q9NY65 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBA8Q9NY65 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA8Q9NY65 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBA8Q9NY65 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA8Q9NY65 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBA8Q9NY65 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms