Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NTN4Q9HB63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTN4Q9HB63 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTN4Q9HB63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTN4Q9HB63 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTN4Q9HB63 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTN4Q9HB63 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTN4Q9HB63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTN4Q9HB63 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTN4Q9HB63 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTN4Q9HB63 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTN4Q9HB63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NTN4Q9HB63 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTN4Q9HB63 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTN4Q9HB63 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTN4Q9HB63 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTN4Q9HB63 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTN4Q9HB63 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTN4Q9HB63 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTN4Q9HB63 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTN4Q9HB63 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NTN4Q9HB63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTN4Q9HB63 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTN4Q9HB63 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTN4Q9HB63 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTN4Q9HB63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTN4Q9HB63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTN4Q9HB63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTN4Q9HB63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms