Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GFRA4Q9GZZ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GFRA4Q9GZZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GFRA4Q9GZZ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GFRA4Q9GZZ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFRA4Q9GZZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFRA4Q9GZZ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA4Q9GZZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA4Q9GZZ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA4Q9GZZ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA4Q9GZZ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA4Q9GZZ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA4Q9GZZ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA4Q9GZZ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GFRA4Q9GZZ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA4Q9GZZ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFRA4Q9GZZ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA4Q9GZZ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA4Q9GZZ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA4Q9GZZ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA4Q9GZZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms