Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP2Q99959 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKP2Q99959 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP2Q99959 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP2Q99959 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP2Q99959 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP2Q99959 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP2Q99959 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP2Q99959 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP2Q99959 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKP2Q99959 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP2Q99959 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP2Q99959 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP2Q99959 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP2Q99959 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP2Q99959 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP2Q99959 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP2Q99959 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PKP2Q99959 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PKP2Q99959 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP2Q99959 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP2Q99959 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP2Q99959 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP2Q99959 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP2Q99959 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKP2Q99959 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKP2Q99959 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKP2Q99959 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP2Q99959 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKP2Q99959 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP2Q99959 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKP2Q99959 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP2Q99959 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP2Q99959 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP2Q99959 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP2Q99959 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP2Q99959 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP2Q99959 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP2Q99959 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP2Q99959 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms