Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HAPLN3Q96S86 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HAPLN3Q96S86 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HAPLN3Q96S86 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HAPLN3Q96S86 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HAPLN3Q96S86 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HAPLN3Q96S86 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HAPLN3Q96S86 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HAPLN3Q96S86 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HAPLN3Q96S86 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HAPLN3Q96S86 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HAPLN3Q96S86 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HAPLN3Q96S86 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HAPLN3Q96S86 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HAPLN3Q96S86 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HAPLN3Q96S86 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HAPLN3Q96S86 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HAPLN3Q96S86 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HAPLN3Q96S86 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HAPLN3Q96S86 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HAPLN3Q96S86 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HAPLN3Q96S86 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HAPLN3Q96S86 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HAPLN3Q96S86 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HAPLN3Q96S86 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HAPLN3Q96S86 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HAPLN3Q96S86 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HAPLN3Q96S86 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HAPLN3Q96S86 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HAPLN3Q96S86 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HAPLN3Q96S86 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HAPLN3Q96S86 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HAPLN3Q96S86 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HAPLN3Q96S86 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HAPLN3Q96S86 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HAPLN3Q96S86 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HAPLN3Q96S86 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HAPLN3Q96S86 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms