Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR60Q8WVS4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR60Q8WVS4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR60Q8WVS4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR60Q8WVS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR60Q8WVS4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR60Q8WVS4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR60Q8WVS4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR60Q8WVS4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR60Q8WVS4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR60Q8WVS4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR60Q8WVS4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR60Q8WVS4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR60Q8WVS4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR60Q8WVS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR60Q8WVS4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR60Q8WVS4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR60Q8WVS4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR60Q8WVS4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR60Q8WVS4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR60Q8WVS4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR60Q8WVS4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR60Q8WVS4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR60Q8WVS4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR60Q8WVS4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR60Q8WVS4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR60Q8WVS4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR60Q8WVS4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR60Q8WVS4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR60Q8WVS4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR60Q8WVS4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR60Q8WVS4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR60Q8WVS4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR60Q8WVS4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms