Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.51■■■□□ 2
WASHC2DQ5SRD0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WASHC2DQ5SRD0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2DQ5SRD0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WASHC2DQ5SRD0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WASHC2DQ5SRD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WASHC2DQ5SRD0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WASHC2DQ5SRD0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WASHC2DQ5SRD0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WASHC2DQ5SRD0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WASHC2DQ5SRD0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WASHC2DQ5SRD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WASHC2DQ5SRD0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WASHC2DQ5SRD0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WASHC2DQ5SRD0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WASHC2DQ5SRD0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
WASHC2DQ5SRD0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
WASHC2DQ5SRD0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
WASHC2DQ5SRD0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms