Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD55Q3KP44 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD55Q3KP44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD55Q3KP44 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD55Q3KP44 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD55Q3KP44 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD55Q3KP44 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD55Q3KP44 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD55Q3KP44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD55Q3KP44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD55Q3KP44 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD55Q3KP44 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD55Q3KP44 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD55Q3KP44 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD55Q3KP44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD55Q3KP44 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD55Q3KP44 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD55Q3KP44 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD55Q3KP44 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD55Q3KP44 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD55Q3KP44 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD55Q3KP44 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD55Q3KP44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD55Q3KP44 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD55Q3KP44 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD55Q3KP44 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD55Q3KP44 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD55Q3KP44 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD55Q3KP44 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD55Q3KP44 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD55Q3KP44 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD55Q3KP44 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms