Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMN1Q16637 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMN1Q16637 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMN1Q16637 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMN1Q16637 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMN1Q16637 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMN1Q16637 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMN1Q16637 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMN1Q16637 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMN1Q16637 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMN1Q16637 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMN1Q16637 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMN1Q16637 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMN1Q16637 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMN1Q16637 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMN1Q16637 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMN1Q16637 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMN1Q16637 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMN1Q16637 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMN1Q16637 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMN1Q16637 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMN1Q16637 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMN1Q16637 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMN1Q16637 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMN1Q16637 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMN1Q16637 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMN1Q16637 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMN1Q16637 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMN1Q16637 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMN1Q16637 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMN1Q16637 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMN1Q16637 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMN1Q16637 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMN1Q16637 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMN1Q16637 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMN1Q16637 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMN1Q16637 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMN1Q16637 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMN1Q16637 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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