Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMED1Q13445 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMED1Q13445 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMED1Q13445 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMED1Q13445 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMED1Q13445 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMED1Q13445 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED1Q13445 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMED1Q13445 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMED1Q13445 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMED1Q13445 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMED1Q13445 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMED1Q13445 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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