Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNC1P63316 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNC1P63316 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNC1P63316 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNC1P63316 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNC1P63316 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNC1P63316 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNC1P63316 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNC1P63316 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNC1P63316 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNC1P63316 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNC1P63316 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNC1P63316 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNC1P63316 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNC1P63316 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNC1P63316 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNC1P63316 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNC1P63316 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNNC1P63316 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNC1P63316 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNC1P63316 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNC1P63316 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNC1P63316 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNC1P63316 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNC1P63316 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNC1P63316 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNNC1P63316 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNC1P63316 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNC1P63316 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNNC1P63316 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNNC1P63316 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNC1P63316 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNC1P63316 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNC1P63316 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNC1P63316 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNC1P63316 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNC1P63316 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNC1P63316 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNC1P63316 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNNC1P63316 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNC1P63316 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms