Protein–RNA interactions for Protein: P23435

CBLN1, Cerebellin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN1P23435 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBLN1P23435 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBLN1P23435 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBLN1P23435 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBLN1P23435 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBLN1P23435 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBLN1P23435 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBLN1P23435 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBLN1P23435 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBLN1P23435 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBLN1P23435 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBLN1P23435 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBLN1P23435 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms