Protein–RNA interactions for Protein: P23435

CBLN1, Cerebellin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN1P23435 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBLN1P23435 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBLN1P23435 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBLN1P23435 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CBLN1P23435 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBLN1P23435 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CBLN1P23435 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBLN1P23435 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBLN1P23435 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBLN1P23435 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBLN1P23435 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBLN1P23435 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBLN1P23435 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBLN1P23435 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBLN1P23435 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBLN1P23435 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBLN1P23435 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBLN1P23435 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBLN1P23435 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBLN1P23435 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBLN1P23435 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBLN1P23435 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBLN1P23435 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLN1P23435 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBLN1P23435 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBLN1P23435 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBLN1P23435 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLN1P23435 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBLN1P23435 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLN1P23435 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLN1P23435 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLN1P23435 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLN1P23435 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBLN1P23435 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBLN1P23435 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBLN1P23435 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBLN1P23435 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBLN1P23435 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLN1P23435 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLN1P23435 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLN1P23435 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLN1P23435 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLN1P23435 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN1P23435 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN1P23435 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLN1P23435 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBLN1P23435 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBLN1P23435 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLN1P23435 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLN1P23435 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLN1P23435 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLN1P23435 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLN1P23435 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLN1P23435 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBLN1P23435 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBLN1P23435 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBLN1P23435 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBLN1P23435 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLN1P23435 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLN1P23435 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLN1P23435 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLN1P23435 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLN1P23435 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLN1P23435 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLN1P23435 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLN1P23435 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN1P23435 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN1P23435 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN1P23435 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CBLN1P23435 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN1P23435 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN1P23435 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN1P23435 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLN1P23435 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLN1P23435 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN1P23435 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN1P23435 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN1P23435 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CBLN1P23435 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBLN1P23435 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN1P23435 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN1P23435 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN1P23435 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBLN1P23435 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN1P23435 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBLN1P23435 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBLN1P23435 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBLN1P23435 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN1P23435 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBLN1P23435 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBLN1P23435 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBLN1P23435 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN1P23435 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN1P23435 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN1P23435 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN1P23435 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN1P23435 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN1P23435 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBLN1P23435 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBLN1P23435 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms