Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGKV4-1P06312 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGKV4-1P06312 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGKV4-1P06312 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGKV4-1P06312 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGKV4-1P06312 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGKV4-1P06312 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGKV4-1P06312 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGKV4-1P06312 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV4-1P06312 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV4-1P06312 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGKV4-1P06312 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGKV4-1P06312 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV4-1P06312 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms