Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IGKV4-1P06312 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGKV4-1P06312 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGKV4-1P06312 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV4-1P06312 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IGKV4-1P06312 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IGKV4-1P06312 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV4-1P06312 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IGKV4-1P06312 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGKV4-1P06312 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IGKV4-1P06312 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IGKV4-1P06312 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGKV4-1P06312 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGKV4-1P06312 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGKV4-1P06312 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV4-1P06312 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV4-1P06312 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV4-1P06312 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGKV4-1P06312 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV4-1P06312 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV4-1P06312 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV4-1P06312 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV4-1P06312 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IGKV4-1P06312 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGKV4-1P06312 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IGKV4-1P06312 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGKV4-1P06312 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IGKV4-1P06312 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGKV4-1P06312 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGKV4-1P06312 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV4-1P06312 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV4-1P06312 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV4-1P06312 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV4-1P06312 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV4-1P06312 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV4-1P06312 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV4-1P06312 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV4-1P06312 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV4-1P06312 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV4-1P06312 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV4-1P06312 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV4-1P06312 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV4-1P06312 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV4-1P06312 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV4-1P06312 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV4-1P06312 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV4-1P06312 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV4-1P06312 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV4-1P06312 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV4-1P06312 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV4-1P06312 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV4-1P06312 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV4-1P06312 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV4-1P06312 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV4-1P06312 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV4-1P06312 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV4-1P06312 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV4-1P06312 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV4-1P06312 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV4-1P06312 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV4-1P06312 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV4-1P06312 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV4-1P06312 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV4-1P06312 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV4-1P06312 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV4-1P06312 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV4-1P06312 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV4-1P06312 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV4-1P06312 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IGKV4-1P06312 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGKV4-1P06312 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGKV4-1P06312 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV4-1P06312 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV4-1P06312 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV4-1P06312 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV4-1P06312 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV4-1P06312 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV4-1P06312 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV4-1P06312 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV4-1P06312 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV4-1P06312 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV4-1P06312 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGKV4-1P06312 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGKV4-1P06312 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGKV4-1P06312 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGKV4-1P06312 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IGKV4-1P06312 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGKV4-1P06312 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGKV4-1P06312 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGKV4-1P06312 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGKV4-1P06312 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGKV4-1P06312 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGKV4-1P06312 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGKV4-1P06312 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IGKV4-1P06312 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IGKV4-1P06312 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGKV4-1P06312 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV4-1P06312 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV4-1P06312 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV4-1P06312 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms