Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBB4AP04350 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TUBB4AP04350 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TUBB4AP04350 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBB4AP04350 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBB4AP04350 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBB4AP04350 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TUBB4AP04350 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUBB4AP04350 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUBB4AP04350 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TUBB4AP04350 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TUBB4AP04350 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TUBB4AP04350 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TUBB4AP04350 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBB4AP04350 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBB4AP04350 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBB4AP04350 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBB4AP04350 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TUBB4AP04350 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TUBB4AP04350 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TUBB4AP04350 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TUBB4AP04350 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBB4AP04350 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBB4AP04350 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB4AP04350 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB4AP04350 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB4AP04350 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB4AP04350 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TUBB4AP04350 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TUBB4AP04350 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB4AP04350 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB4AP04350 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBB4AP04350 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBB4AP04350 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBB4AP04350 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TUBB4AP04350 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TUBB4AP04350 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TUBB4AP04350 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TUBB4AP04350 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBB4AP04350 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBB4AP04350 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBB4AP04350 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBB4AP04350 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBB4AP04350 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBB4AP04350 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBB4AP04350 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBB4AP04350 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TUBB4AP04350 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TUBB4AP04350 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB4AP04350 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB4AP04350 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms