Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TUBB4AP04350 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TUBB4AP04350 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TUBB4AP04350 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TUBB4AP04350 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TUBB4AP04350 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TUBB4AP04350 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TUBB4AP04350 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TUBB4AP04350 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TUBB4AP04350 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TUBB4AP04350 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TUBB4AP04350 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TUBB4AP04350 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TUBB4AP04350 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TUBB4AP04350 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TUBB4AP04350 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TUBB4AP04350 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TUBB4AP04350 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBB4AP04350 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TUBB4AP04350 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TUBB4AP04350 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TUBB4AP04350 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TUBB4AP04350 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TUBB4AP04350 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TUBB4AP04350 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TUBB4AP04350 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TUBB4AP04350 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TUBB4AP04350 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TUBB4AP04350 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TUBB4AP04350 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TUBB4AP04350 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TUBB4AP04350 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TUBB4AP04350 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TUBB4AP04350 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TUBB4AP04350 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TUBB4AP04350 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TUBB4AP04350 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TUBB4AP04350 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TUBB4AP04350 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TUBB4AP04350 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TUBB4AP04350 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TUBB4AP04350 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TUBB4AP04350 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TUBB4AP04350 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TUBB4AP04350 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TUBB4AP04350 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TUBB4AP04350 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TUBB4AP04350 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TUBB4AP04350 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TUBB4AP04350 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TUBB4AP04350 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TUBB4AP04350 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TUBB4AP04350 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TUBB4AP04350 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TUBB4AP04350 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TUBB4AP04350 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TUBB4AP04350 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TUBB4AP04350 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TUBB4AP04350 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TUBB4AP04350 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TUBB4AP04350 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TUBB4AP04350 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TUBB4AP04350 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TUBB4AP04350 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TUBB4AP04350 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TUBB4AP04350 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TUBB4AP04350 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TUBB4AP04350 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TUBB4AP04350 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TUBB4AP04350 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TUBB4AP04350 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TUBB4AP04350 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TUBB4AP04350 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TUBB4AP04350 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TUBB4AP04350 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TUBB4AP04350 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TUBB4AP04350 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TUBB4AP04350 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TUBB4AP04350 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TUBB4AP04350 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TUBB4AP04350 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TUBB4AP04350 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TUBB4AP04350 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
TUBB4AP04350 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TUBB4AP04350 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TUBB4AP04350 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TUBB4AP04350 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TUBB4AP04350 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TUBB4AP04350 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TUBB4AP04350 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TUBB4AP04350 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TUBB4AP04350 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TUBB4AP04350 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TUBB4AP04350 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TUBB4AP04350 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TUBB4AP04350 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TUBB4AP04350 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
TUBB4AP04350 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TUBB4AP04350 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TUBB4AP04350 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms