Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG12O94817 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG12O94817 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG12O94817 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG12O94817 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG12O94817 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG12O94817 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG12O94817 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG12O94817 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG12O94817 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG12O94817 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG12O94817 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG12O94817 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG12O94817 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG12O94817 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG12O94817 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG12O94817 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG12O94817 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG12O94817 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG12O94817 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG12O94817 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG12O94817 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG12O94817 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG12O94817 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG12O94817 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG12O94817 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG12O94817 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG12O94817 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG12O94817 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG12O94817 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG12O94817 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG12O94817 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG12O94817 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG12O94817 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG12O94817 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG12O94817 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG12O94817 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG12O94817 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG12O94817 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG12O94817 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG12O94817 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG12O94817 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG12O94817 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG12O94817 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG12O94817 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG12O94817 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG12O94817 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG12O94817 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG12O94817 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG12O94817 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG12O94817 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG12O94817 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG12O94817 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG12O94817 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG12O94817 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG12O94817 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG12O94817 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG12O94817 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG12O94817 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG12O94817 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG12O94817 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG12O94817 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG12O94817 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG12O94817 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG12O94817 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG12O94817 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG12O94817 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG12O94817 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG12O94817 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG12O94817 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG12O94817 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG12O94817 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG12O94817 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG12O94817 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG12O94817 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG12O94817 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG12O94817 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG12O94817 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG12O94817 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG12O94817 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG12O94817 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG12O94817 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG12O94817 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG12O94817 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG12O94817 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG12O94817 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG12O94817 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG12O94817 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG12O94817 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG12O94817 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG12O94817 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG12O94817 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG12O94817 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG12O94817 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG12O94817 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG12O94817 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG12O94817 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG12O94817 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG12O94817 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG12O94817 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms