Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTN2O75298 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTN2O75298 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTN2O75298 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTN2O75298 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTN2O75298 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTN2O75298 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTN2O75298 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTN2O75298 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTN2O75298 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTN2O75298 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN2O75298 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN2O75298 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN2O75298 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN2O75298 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTN2O75298 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTN2O75298 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTN2O75298 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTN2O75298 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN2O75298 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN2O75298 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN2O75298 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN2O75298 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTN2O75298 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTN2O75298 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTN2O75298 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTN2O75298 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTN2O75298 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTN2O75298 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTN2O75298 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTN2O75298 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN2O75298 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN2O75298 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN2O75298 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN2O75298 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTN2O75298 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTN2O75298 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTN2O75298 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTN2O75298 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN2O75298 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN2O75298 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN2O75298 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTN2O75298 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTN2O75298 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RTN2O75298 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTN2O75298 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTN2O75298 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTN2O75298 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTN2O75298 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN2O75298 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN2O75298 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN2O75298 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN2O75298 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN2O75298 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN2O75298 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN2O75298 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN2O75298 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTN2O75298 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN2O75298 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN2O75298 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN2O75298 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN2O75298 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN2O75298 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN2O75298 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN2O75298 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN2O75298 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN2O75298 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN2O75298 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN2O75298 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN2O75298 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTN2O75298 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTN2O75298 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTN2O75298 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTN2O75298 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTN2O75298 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTN2O75298 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN2O75298 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN2O75298 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN2O75298 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RTN2O75298 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTN2O75298 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN2O75298 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN2O75298 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN2O75298 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN2O75298 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTN2O75298 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTN2O75298 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTN2O75298 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTN2O75298 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTN2O75298 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN2O75298 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN2O75298 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN2O75298 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN2O75298 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTN2O75298 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTN2O75298 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTN2O75298 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTN2O75298 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTN2O75298 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTN2O75298 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms