Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB1P1B2RPK0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB1P1B2RPK0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGB1P1B2RPK0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB1P1B2RPK0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB1P1B2RPK0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGB1P1B2RPK0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB1P1B2RPK0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB1P1B2RPK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HMGB1P1B2RPK0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HMGB1P1B2RPK0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB1P1B2RPK0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB1P1B2RPK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB1P1B2RPK0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB1P1B2RPK0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB1P1B2RPK0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGB1P1B2RPK0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGB1P1B2RPK0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB1P1B2RPK0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB1P1B2RPK0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB1P1B2RPK0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB1P1B2RPK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGB1P1B2RPK0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB1P1B2RPK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB1P1B2RPK0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB1P1B2RPK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB1P1B2RPK0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGB1P1B2RPK0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB1P1B2RPK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB1P1B2RPK0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB1P1B2RPK0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGB1P1B2RPK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGB1P1B2RPK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB1P1B2RPK0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB1P1B2RPK0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB1P1B2RPK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB1P1B2RPK0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGB1P1B2RPK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB1P1B2RPK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms