Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE1LA8MT33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1LA8MT33 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1LA8MT33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1LA8MT33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1LA8MT33 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCE1LA8MT33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE1LA8MT33 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE1LA8MT33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE1LA8MT33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCE1LA8MT33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE1LA8MT33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE1LA8MT33 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCE1LA8MT33 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCE1LA8MT33 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCE1LA8MT33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYCE1LA8MT33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCE1LA8MT33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCE1LA8MT33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE1LA8MT33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE1LA8MT33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE1LA8MT33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE1LA8MT33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE1LA8MT33 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE1LA8MT33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCE1LA8MT33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCE1LA8MT33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE1LA8MT33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE1LA8MT33 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE1LA8MT33 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE1LA8MT33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms