Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYCE1LA8MT33 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCE1LA8MT33 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYCE1LA8MT33 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SYCE1LA8MT33 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCE1LA8MT33 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCE1LA8MT33 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCE1LA8MT33 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYCE1LA8MT33 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYCE1LA8MT33 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCE1LA8MT33 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCE1LA8MT33 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCE1LA8MT33 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYCE1LA8MT33 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYCE1LA8MT33 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCE1LA8MT33 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCE1LA8MT33 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCE1LA8MT33 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCE1LA8MT33 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCE1LA8MT33 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCE1LA8MT33 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYCE1LA8MT33 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCE1LA8MT33 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCE1LA8MT33 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCE1LA8MT33 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYCE1LA8MT33 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYCE1LA8MT33 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYCE1LA8MT33 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYCE1LA8MT33 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCE1LA8MT33 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYCE1LA8MT33 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYCE1LA8MT33 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCE1LA8MT33 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCE1LA8MT33 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCE1LA8MT33 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCE1LA8MT33 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCE1LA8MT33 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCE1LA8MT33 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCE1LA8MT33 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCE1LA8MT33 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCE1LA8MT33 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYCE1LA8MT33 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCE1LA8MT33 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCE1LA8MT33 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCE1LA8MT33 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCE1LA8MT33 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCE1LA8MT33 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCE1LA8MT33 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCE1LA8MT33 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCE1LA8MT33 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYCE1LA8MT33 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCE1LA8MT33 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCE1LA8MT33 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYCE1LA8MT33 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCE1LA8MT33 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCE1LA8MT33 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCE1LA8MT33 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCE1LA8MT33 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCE1LA8MT33 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCE1LA8MT33 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCE1LA8MT33 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCE1LA8MT33 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCE1LA8MT33 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCE1LA8MT33 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCE1LA8MT33 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCE1LA8MT33 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCE1LA8MT33 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCE1LA8MT33 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCE1LA8MT33 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCE1LA8MT33 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCE1LA8MT33 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCE1LA8MT33 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE1LA8MT33 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE1LA8MT33 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCE1LA8MT33 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCE1LA8MT33 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCE1LA8MT33 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCE1LA8MT33 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCE1LA8MT33 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCE1LA8MT33 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCE1LA8MT33 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCE1LA8MT33 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCE1LA8MT33 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCE1LA8MT33 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCE1LA8MT33 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCE1LA8MT33 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCE1LA8MT33 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCE1LA8MT33 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCE1LA8MT33 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCE1LA8MT33 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCE1LA8MT33 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYCE1LA8MT33 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCE1LA8MT33 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCE1LA8MT33 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCE1LA8MT33 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCE1LA8MT33 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE1LA8MT33 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCE1LA8MT33 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCE1LA8MT33 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCE1LA8MT33 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms