Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A6NNZ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
A6NNZ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
A6NNZ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A6NNZ2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
A6NNZ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A6NNZ2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A6NNZ2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
A6NNZ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A6NNZ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A6NNZ2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A6NNZ2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A6NNZ2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A6NNZ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A6NNZ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A6NNZ2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
A6NNZ2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A6NNZ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
A6NNZ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
A6NNZ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A6NNZ2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A6NNZ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A6NNZ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A6NNZ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A6NNZ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A6NNZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A6NNZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A6NNZ2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
A6NNZ2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
A6NNZ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
A6NNZ2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
A6NNZ2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
A6NNZ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A6NNZ2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A6NNZ2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
A6NNZ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A6NNZ2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A6NNZ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A6NNZ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A6NNZ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
A6NNZ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
A6NNZ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
A6NNZ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
A6NNZ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
A6NNZ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
A6NNZ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
A6NNZ2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
A6NNZ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
A6NNZ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A6NNZ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A6NNZ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
A6NNZ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
A6NNZ2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
A6NNZ2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
A6NNZ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
A6NNZ2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
A6NNZ2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
A6NNZ2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
A6NNZ2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
A6NNZ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
A6NNZ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A6NNZ2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A6NNZ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
A6NNZ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
A6NNZ2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
A6NNZ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
A6NNZ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A6NNZ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
A6NNZ2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A6NNZ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A6NNZ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
A6NNZ2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
A6NNZ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
A6NNZ2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
A6NNZ2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
A6NNZ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
A6NNZ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
A6NNZ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
A6NNZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
A6NNZ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A6NNZ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
A6NNZ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A6NNZ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
A6NNZ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A6NNZ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A6NNZ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
A6NNZ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A6NNZ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A6NNZ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A6NNZ2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A6NNZ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A6NNZ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A6NNZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
A6NNZ2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A6NNZ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A6NNZ2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
A6NNZ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A6NNZ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A6NNZ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
A6NNZ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms