Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCMTD2Q9NV79 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCMTD2Q9NV79 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCMTD2Q9NV79 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCMTD2Q9NV79 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCMTD2Q9NV79 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCMTD2Q9NV79 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCMTD2Q9NV79 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCMTD2Q9NV79 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCMTD2Q9NV79 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCMTD2Q9NV79 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PCMTD2Q9NV79 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCMTD2Q9NV79 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCMTD2Q9NV79 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCMTD2Q9NV79 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCMTD2Q9NV79 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCMTD2Q9NV79 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCMTD2Q9NV79 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PCMTD2Q9NV79 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCMTD2Q9NV79 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCMTD2Q9NV79 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCMTD2Q9NV79 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCMTD2Q9NV79 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCMTD2Q9NV79 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCMTD2Q9NV79 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCMTD2Q9NV79 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCMTD2Q9NV79 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCMTD2Q9NV79 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCMTD2Q9NV79 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCMTD2Q9NV79 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCMTD2Q9NV79 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCMTD2Q9NV79 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCMTD2Q9NV79 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCMTD2Q9NV79 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCMTD2Q9NV79 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCMTD2Q9NV79 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCMTD2Q9NV79 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCMTD2Q9NV79 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCMTD2Q9NV79 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCMTD2Q9NV79 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCMTD2Q9NV79 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCMTD2Q9NV79 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCMTD2Q9NV79 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCMTD2Q9NV79 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCMTD2Q9NV79 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCMTD2Q9NV79 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCMTD2Q9NV79 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCMTD2Q9NV79 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCMTD2Q9NV79 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCMTD2Q9NV79 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCMTD2Q9NV79 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCMTD2Q9NV79 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCMTD2Q9NV79 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCMTD2Q9NV79 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCMTD2Q9NV79 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCMTD2Q9NV79 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCMTD2Q9NV79 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCMTD2Q9NV79 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCMTD2Q9NV79 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMTD2Q9NV79 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms