Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCM2LQ9NUG4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCM2LQ9NUG4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCM2LQ9NUG4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCM2LQ9NUG4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCM2LQ9NUG4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCM2LQ9NUG4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCM2LQ9NUG4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCM2LQ9NUG4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCM2LQ9NUG4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCM2LQ9NUG4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCM2LQ9NUG4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCM2LQ9NUG4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCM2LQ9NUG4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCM2LQ9NUG4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCM2LQ9NUG4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCM2LQ9NUG4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCM2LQ9NUG4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCM2LQ9NUG4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCM2LQ9NUG4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCM2LQ9NUG4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCM2LQ9NUG4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCM2LQ9NUG4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCM2LQ9NUG4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCM2LQ9NUG4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCM2LQ9NUG4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCM2LQ9NUG4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCM2LQ9NUG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCM2LQ9NUG4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCM2LQ9NUG4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCM2LQ9NUG4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCM2LQ9NUG4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCM2LQ9NUG4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCM2LQ9NUG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCM2LQ9NUG4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCM2LQ9NUG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCM2LQ9NUG4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCM2LQ9NUG4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCM2LQ9NUG4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCM2LQ9NUG4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCM2LQ9NUG4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCM2LQ9NUG4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCM2LQ9NUG4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCM2LQ9NUG4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCM2LQ9NUG4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCM2LQ9NUG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCM2LQ9NUG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCM2LQ9NUG4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCM2LQ9NUG4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCM2LQ9NUG4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCM2LQ9NUG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCM2LQ9NUG4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCM2LQ9NUG4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCM2LQ9NUG4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCM2LQ9NUG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCM2LQ9NUG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCM2LQ9NUG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCM2LQ9NUG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCM2LQ9NUG4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCM2LQ9NUG4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCM2LQ9NUG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCM2LQ9NUG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCM2LQ9NUG4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCM2LQ9NUG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCM2LQ9NUG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms