Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IL1RAPQ9NPH3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IL1RAPQ9NPH3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IL1RAPQ9NPH3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IL1RAPQ9NPH3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IL1RAPQ9NPH3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IL1RAPQ9NPH3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IL1RAPQ9NPH3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IL1RAPQ9NPH3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IL1RAPQ9NPH3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IL1RAPQ9NPH3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IL1RAPQ9NPH3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IL1RAPQ9NPH3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IL1RAPQ9NPH3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IL1RAPQ9NPH3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IL1RAPQ9NPH3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IL1RAPQ9NPH3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IL1RAPQ9NPH3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IL1RAPQ9NPH3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IL1RAPQ9NPH3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IL1RAPQ9NPH3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IL1RAPQ9NPH3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IL1RAPQ9NPH3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IL1RAPQ9NPH3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IL1RAPQ9NPH3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IL1RAPQ9NPH3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IL1RAPQ9NPH3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IL1RAPQ9NPH3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IL1RAPQ9NPH3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IL1RAPQ9NPH3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IL1RAPQ9NPH3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IL1RAPQ9NPH3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IL1RAPQ9NPH3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IL1RAPQ9NPH3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IL1RAPQ9NPH3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IL1RAPQ9NPH3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IL1RAPQ9NPH3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IL1RAPQ9NPH3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IL1RAPQ9NPH3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IL1RAPQ9NPH3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IL1RAPQ9NPH3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IL1RAPQ9NPH3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IL1RAPQ9NPH3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IL1RAPQ9NPH3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IL1RAPQ9NPH3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IL1RAPQ9NPH3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IL1RAPQ9NPH3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IL1RAPQ9NPH3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IL1RAPQ9NPH3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IL1RAPQ9NPH3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IL1RAPQ9NPH3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IL1RAPQ9NPH3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IL1RAPQ9NPH3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IL1RAPQ9NPH3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IL1RAPQ9NPH3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IL1RAPQ9NPH3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IL1RAPQ9NPH3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IL1RAPQ9NPH3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IL1RAPQ9NPH3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IL1RAPQ9NPH3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IL1RAPQ9NPH3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IL1RAPQ9NPH3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IL1RAPQ9NPH3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IL1RAPQ9NPH3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IL1RAPQ9NPH3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IL1RAPQ9NPH3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IL1RAPQ9NPH3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IL1RAPQ9NPH3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IL1RAPQ9NPH3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IL1RAPQ9NPH3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IL1RAPQ9NPH3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms