Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IL1RAPQ9NPH3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
IL1RAPQ9NPH3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IL1RAPQ9NPH3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
IL1RAPQ9NPH3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
IL1RAPQ9NPH3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
IL1RAPQ9NPH3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IL1RAPQ9NPH3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IL1RAPQ9NPH3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IL1RAPQ9NPH3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IL1RAPQ9NPH3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IL1RAPQ9NPH3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IL1RAPQ9NPH3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IL1RAPQ9NPH3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IL1RAPQ9NPH3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IL1RAPQ9NPH3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IL1RAPQ9NPH3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IL1RAPQ9NPH3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IL1RAPQ9NPH3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IL1RAPQ9NPH3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
IL1RAPQ9NPH3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IL1RAPQ9NPH3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IL1RAPQ9NPH3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IL1RAPQ9NPH3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IL1RAPQ9NPH3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IL1RAPQ9NPH3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IL1RAPQ9NPH3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IL1RAPQ9NPH3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IL1RAPQ9NPH3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IL1RAPQ9NPH3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IL1RAPQ9NPH3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IL1RAPQ9NPH3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IL1RAPQ9NPH3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IL1RAPQ9NPH3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IL1RAPQ9NPH3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IL1RAPQ9NPH3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IL1RAPQ9NPH3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IL1RAPQ9NPH3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IL1RAPQ9NPH3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IL1RAPQ9NPH3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IL1RAPQ9NPH3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IL1RAPQ9NPH3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IL1RAPQ9NPH3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IL1RAPQ9NPH3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IL1RAPQ9NPH3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IL1RAPQ9NPH3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IL1RAPQ9NPH3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IL1RAPQ9NPH3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IL1RAPQ9NPH3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IL1RAPQ9NPH3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IL1RAPQ9NPH3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IL1RAPQ9NPH3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IL1RAPQ9NPH3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IL1RAPQ9NPH3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IL1RAPQ9NPH3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IL1RAPQ9NPH3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IL1RAPQ9NPH3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IL1RAPQ9NPH3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IL1RAPQ9NPH3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IL1RAPQ9NPH3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IL1RAPQ9NPH3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IL1RAPQ9NPH3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IL1RAPQ9NPH3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IL1RAPQ9NPH3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IL1RAPQ9NPH3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IL1RAPQ9NPH3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IL1RAPQ9NPH3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IL1RAPQ9NPH3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IL1RAPQ9NPH3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IL1RAPQ9NPH3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IL1RAPQ9NPH3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IL1RAPQ9NPH3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IL1RAPQ9NPH3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IL1RAPQ9NPH3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1RAPQ9NPH3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IL1RAPQ9NPH3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL1RAPQ9NPH3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL1RAPQ9NPH3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IL1RAPQ9NPH3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IL1RAPQ9NPH3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IL1RAPQ9NPH3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IL1RAPQ9NPH3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IL1RAPQ9NPH3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL1RAPQ9NPH3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IL1RAPQ9NPH3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IL1RAPQ9NPH3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IL1RAPQ9NPH3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IL1RAPQ9NPH3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IL1RAPQ9NPH3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms