Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC4CQ9HCJ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRC4CQ9HCJ2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC4CQ9HCJ2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4CQ9HCJ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC4CQ9HCJ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC4CQ9HCJ2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC4CQ9HCJ2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC4CQ9HCJ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC4CQ9HCJ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4CQ9HCJ2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC4CQ9HCJ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC4CQ9HCJ2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC4CQ9HCJ2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC4CQ9HCJ2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC4CQ9HCJ2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC4CQ9HCJ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC4CQ9HCJ2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC4CQ9HCJ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC4CQ9HCJ2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC4CQ9HCJ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC4CQ9HCJ2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC4CQ9HCJ2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC4CQ9HCJ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC4CQ9HCJ2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC4CQ9HCJ2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC4CQ9HCJ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC4CQ9HCJ2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC4CQ9HCJ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC4CQ9HCJ2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC4CQ9HCJ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC4CQ9HCJ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4CQ9HCJ2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4CQ9HCJ2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4CQ9HCJ2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4CQ9HCJ2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC4CQ9HCJ2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC4CQ9HCJ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC4CQ9HCJ2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC4CQ9HCJ2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4CQ9HCJ2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4CQ9HCJ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4CQ9HCJ2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC4CQ9HCJ2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4CQ9HCJ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4CQ9HCJ2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4CQ9HCJ2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC4CQ9HCJ2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC4CQ9HCJ2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4CQ9HCJ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4CQ9HCJ2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4CQ9HCJ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4CQ9HCJ2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4CQ9HCJ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4CQ9HCJ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC4CQ9HCJ2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC4CQ9HCJ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC4CQ9HCJ2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC4CQ9HCJ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC4CQ9HCJ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC4CQ9HCJ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC4CQ9HCJ2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC4CQ9HCJ2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC4CQ9HCJ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC4CQ9HCJ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC4CQ9HCJ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC4CQ9HCJ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC4CQ9HCJ2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4CQ9HCJ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC4CQ9HCJ2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC4CQ9HCJ2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC4CQ9HCJ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4CQ9HCJ2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4CQ9HCJ2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4CQ9HCJ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC4CQ9HCJ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC4CQ9HCJ2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4CQ9HCJ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4CQ9HCJ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4CQ9HCJ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4CQ9HCJ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4CQ9HCJ2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4CQ9HCJ2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4CQ9HCJ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4CQ9HCJ2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4CQ9HCJ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC4CQ9HCJ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC4CQ9HCJ2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4CQ9HCJ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4CQ9HCJ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms