Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC106Q9BWC9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC106Q9BWC9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC106Q9BWC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC106Q9BWC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC106Q9BWC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC106Q9BWC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC106Q9BWC9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC106Q9BWC9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC106Q9BWC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC106Q9BWC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC106Q9BWC9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC106Q9BWC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC106Q9BWC9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC106Q9BWC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC106Q9BWC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC106Q9BWC9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC106Q9BWC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC106Q9BWC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC106Q9BWC9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC106Q9BWC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC106Q9BWC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC106Q9BWC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC106Q9BWC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC106Q9BWC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC106Q9BWC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC106Q9BWC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC106Q9BWC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC106Q9BWC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC106Q9BWC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC106Q9BWC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC106Q9BWC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC106Q9BWC9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC106Q9BWC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC106Q9BWC9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC106Q9BWC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC106Q9BWC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC106Q9BWC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC106Q9BWC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC106Q9BWC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC106Q9BWC9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC106Q9BWC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC106Q9BWC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC106Q9BWC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC106Q9BWC9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC106Q9BWC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC106Q9BWC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC106Q9BWC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC106Q9BWC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC106Q9BWC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC106Q9BWC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC106Q9BWC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC106Q9BWC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC106Q9BWC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC106Q9BWC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC106Q9BWC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC106Q9BWC9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC106Q9BWC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC106Q9BWC9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC106Q9BWC9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC106Q9BWC9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC106Q9BWC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC106Q9BWC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC106Q9BWC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC106Q9BWC9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC106Q9BWC9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC106Q9BWC9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC106Q9BWC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC106Q9BWC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC106Q9BWC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC106Q9BWC9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC106Q9BWC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC106Q9BWC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC106Q9BWC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC106Q9BWC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC106Q9BWC9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC106Q9BWC9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC106Q9BWC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC106Q9BWC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC106Q9BWC9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC106Q9BWC9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC106Q9BWC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC106Q9BWC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC106Q9BWC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms