Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ1

Uncharacterized protein FLJ30774, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96NJ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q96NJ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q96NJ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q96NJ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q96NJ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q96NJ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q96NJ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q96NJ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q96NJ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q96NJ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q96NJ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q96NJ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q96NJ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q96NJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q96NJ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q96NJ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q96NJ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q96NJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q96NJ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q96NJ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q96NJ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q96NJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q96NJ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q96NJ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q96NJ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q96NJ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q96NJ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q96NJ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q96NJ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q96NJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q96NJ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q96NJ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q96NJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q96NJ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q96NJ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q96NJ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q96NJ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q96NJ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q96NJ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q96NJ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q96NJ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q96NJ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q96NJ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q96NJ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q96NJ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q96NJ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q96NJ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q96NJ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q96NJ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q96NJ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q96NJ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q96NJ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q96NJ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q96NJ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96NJ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q96NJ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96NJ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96NJ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96NJ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q96NJ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q96NJ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q96NJ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q96NJ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q96NJ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q96NJ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q96NJ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q96NJ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q96NJ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q96NJ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q96NJ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q96NJ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q96NJ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q96NJ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q96NJ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q96NJ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q96NJ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q96NJ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q96NJ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q96NJ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q96NJ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q96NJ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q96NJ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q96NJ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q96NJ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q96NJ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q96NJ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96NJ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96NJ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96NJ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96NJ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96NJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96NJ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q96NJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q96NJ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q96NJ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96NJ1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96NJ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96NJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96NJ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96NJ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms