Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX33Q8WV41 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX33Q8WV41 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX33Q8WV41 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX33Q8WV41 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX33Q8WV41 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX33Q8WV41 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX33Q8WV41 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX33Q8WV41 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX33Q8WV41 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX33Q8WV41 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX33Q8WV41 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX33Q8WV41 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SNX33Q8WV41 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX33Q8WV41 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX33Q8WV41 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX33Q8WV41 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX33Q8WV41 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX33Q8WV41 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX33Q8WV41 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX33Q8WV41 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX33Q8WV41 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX33Q8WV41 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX33Q8WV41 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX33Q8WV41 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX33Q8WV41 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX33Q8WV41 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX33Q8WV41 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX33Q8WV41 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX33Q8WV41 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX33Q8WV41 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX33Q8WV41 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX33Q8WV41 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX33Q8WV41 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX33Q8WV41 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX33Q8WV41 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX33Q8WV41 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX33Q8WV41 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX33Q8WV41 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX33Q8WV41 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX33Q8WV41 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX33Q8WV41 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX33Q8WV41 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX33Q8WV41 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX33Q8WV41 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX33Q8WV41 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX33Q8WV41 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX33Q8WV41 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX33Q8WV41 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX33Q8WV41 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX33Q8WV41 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX33Q8WV41 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX33Q8WV41 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX33Q8WV41 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX33Q8WV41 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX33Q8WV41 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX33Q8WV41 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX33Q8WV41 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX33Q8WV41 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX33Q8WV41 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX33Q8WV41 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX33Q8WV41 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX33Q8WV41 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX33Q8WV41 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX33Q8WV41 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX33Q8WV41 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX33Q8WV41 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms