Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNX33Q8WV41 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNX33Q8WV41 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX33Q8WV41 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX33Q8WV41 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX33Q8WV41 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX33Q8WV41 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX33Q8WV41 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX33Q8WV41 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX33Q8WV41 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX33Q8WV41 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX33Q8WV41 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX33Q8WV41 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX33Q8WV41 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX33Q8WV41 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX33Q8WV41 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX33Q8WV41 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX33Q8WV41 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX33Q8WV41 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX33Q8WV41 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX33Q8WV41 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX33Q8WV41 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX33Q8WV41 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX33Q8WV41 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX33Q8WV41 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX33Q8WV41 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX33Q8WV41 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX33Q8WV41 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX33Q8WV41 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX33Q8WV41 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX33Q8WV41 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX33Q8WV41 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX33Q8WV41 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX33Q8WV41 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX33Q8WV41 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX33Q8WV41 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX33Q8WV41 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX33Q8WV41 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX33Q8WV41 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX33Q8WV41 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX33Q8WV41 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX33Q8WV41 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX33Q8WV41 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX33Q8WV41 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX33Q8WV41 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX33Q8WV41 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX33Q8WV41 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX33Q8WV41 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX33Q8WV41 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX33Q8WV41 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX33Q8WV41 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX33Q8WV41 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX33Q8WV41 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX33Q8WV41 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX33Q8WV41 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX33Q8WV41 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX33Q8WV41 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX33Q8WV41 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX33Q8WV41 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX33Q8WV41 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX33Q8WV41 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX33Q8WV41 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX33Q8WV41 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX33Q8WV41 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX33Q8WV41 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX33Q8WV41 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX33Q8WV41 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX33Q8WV41 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX33Q8WV41 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX33Q8WV41 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX33Q8WV41 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX33Q8WV41 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX33Q8WV41 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX33Q8WV41 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX33Q8WV41 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX33Q8WV41 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX33Q8WV41 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX33Q8WV41 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX33Q8WV41 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX33Q8WV41 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX33Q8WV41 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX33Q8WV41 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX33Q8WV41 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX33Q8WV41 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX33Q8WV41 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX33Q8WV41 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX33Q8WV41 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX33Q8WV41 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX33Q8WV41 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX33Q8WV41 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX33Q8WV41 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX33Q8WV41 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX33Q8WV41 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX33Q8WV41 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX33Q8WV41 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX33Q8WV41 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX33Q8WV41 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX33Q8WV41 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX33Q8WV41 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX33Q8WV41 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms