Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCN1P1Q5VSP4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCN1P1Q5VSP4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCN1P1Q5VSP4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LCN1P1Q5VSP4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN1P1Q5VSP4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN1P1Q5VSP4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCN1P1Q5VSP4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN1P1Q5VSP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCN1P1Q5VSP4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCN1P1Q5VSP4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN1P1Q5VSP4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN1P1Q5VSP4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN1P1Q5VSP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN1P1Q5VSP4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCN1P1Q5VSP4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCN1P1Q5VSP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCN1P1Q5VSP4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCN1P1Q5VSP4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN1P1Q5VSP4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN1P1Q5VSP4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCN1P1Q5VSP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCN1P1Q5VSP4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN1P1Q5VSP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN1P1Q5VSP4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCN1P1Q5VSP4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCN1P1Q5VSP4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN1P1Q5VSP4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN1P1Q5VSP4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN1P1Q5VSP4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN1P1Q5VSP4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN1P1Q5VSP4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCN1P1Q5VSP4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P1Q5VSP4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCN1P1Q5VSP4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCN1P1Q5VSP4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LCN1P1Q5VSP4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCN1P1Q5VSP4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN1P1Q5VSP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN1P1Q5VSP4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN1P1Q5VSP4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCN1P1Q5VSP4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCN1P1Q5VSP4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCN1P1Q5VSP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCN1P1Q5VSP4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCN1P1Q5VSP4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCN1P1Q5VSP4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCN1P1Q5VSP4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCN1P1Q5VSP4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCN1P1Q5VSP4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCN1P1Q5VSP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms